| I. В центральном аппарате ФТС России |
| Главное управление тылового обеспечения |
| 1. Отдел документационного обеспечения |
| 2. Отдел сводного планирования тылового обеспечения |
| 3. Отдел обязательного личного и имущественного страхования |
| 4. Планово-экономический отдел |
| 5. Отдел проектирования |
| 6. Отдел экспертизы |
| 7. Отдел капитального строительства |
| 8. Отдел капитального ремонта |
| 9. Отдел эксплуатации |
| 10. Отдел развития таможенной инфраструктуры |
| 11. Отдел обеспечения техническими средствами таможенного контроля и оргтехникой |
| 12. Отдел обеспечения транспортом и специальной техникой |
| 13. Отдел обеспечения печатной продукцией |
| 14. Отдел вещевого обеспечения |
| 15. Отдел комплексного социального развития |
| 16. Отдел охраны труда и гражданской обороны |
| 17. Отдел координации деятельности тыловых подразделений таможенных органов |
| 18. Отдел организации и планирования медицинского обеспечения |
| 19. Лечебно-профилактический отдел |
| 20. Санаторно-курортный отдел |
| 21. Отдел военно-врачебной экспертизы (ЦВВК ФТС России) |
| II. В региональном таможенном управлении |
| Тыловая служба |
| 1. Отдел капитального строительства |
| 2. Отдел материально-технического обеспечения |
| 3. Отдел эксплуатации объектов таможенной инфраструктуры |
| 4. Отдел охраны труда и пожарной безопасности |
| 5. Отдел социального развития |
| 6. Отдел медицинского обеспечения |
| 7. Автотранспортный отдел |
| 8. Отдел конкурсных торгов |
| III. В таможне |
| 1. Отдел тылового обеспечения |
| 2. Отдел материально-технического обеспечения |
| 3. Автотранспортный отдел |
| 4. Отдел социального развития |
| 5. Отдел охраны труда и пожарной безопасности |
| IV. На таможенном посту |
| 1. Отдел тылового обеспечения |
| 2. Отдел конкурсных торгов |
| 3. Отдел материально-технического обеспечения |
| 4. Автотранспортный отдел |