Страницы: 1 2 ЭПИДЕМИОЛОГИЯ. ОРГАНИЗАЦИЯ РАБОТЫ ПРИ ИССЛЕДОВАНИЯХ МЕТОДОМ ПЦР МАТЕРИАЛА, ИНФИЦИРОВАННОГО МИКРООРГАНИЗМАМИ I - II ГРУПП ПАТОГЕННОСТИ МЕТОДИКА ГЛАВНЫЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ САНИТАРНЫЙ ВРАЧ РФ 5 декабря 2003 г. N МУ 1.3.1794-03 (Д) УТВЕРЖДАЮ Главный государственный санитарный врач Российской Федерации, Первый заместитель Министра здравоохранения Российской Федерации Г.Г.ОНИЩЕНКО 5 декабря 2003 года Дата введения - с момента утверждения 1. Разработаны: Департаментом госсанэпиднадзора Минздрава России (М.П. Шевырева, Ю.М. Федоров); Центром по генной диагностике особо опасных инфекционных заболеваний Минздрава России на базе Российского научно-исследовательского противочумного института "Микроб" (В.В. Кутырев, А.Н. Куличенко, Н.А. Осина, И.Н. Шарова, М.Н. Ляпин, И.Г. Дроздов); Федеральным центром госсанэпиднадзора Минздрава России (Е.Н. Беляев, И.В. Брагина, А.А. Ясинский, Э.Ф. Опочинский, Т.В. Воронцова, М.В. Зароченцев); ЦНИИ эпидемиологии Минздрава России (В.И. Покровский, Н.А. Семина, Г.А. Шипулин, Е.Н. Родионова); Противочумным центром Минздрава России (В.Е. Безсмертный, С.М. Иванова, Ю.А. Панин); ГИСК им. Л.А. Тарасевича (Т.А. Бектимиров, Р.А. Волкова, М.С. Воробьева, Л.В. Саяпина); Ростовским-на-Дону научно-исследовательским противочумным институтом (И.Ю. Сучков, С.О. Водопьянов, Б.Н. Мишанькин); Ставропольским научно-исследовательским противочумным институтом (Е.И. Еременко, А.Ф. Брюханов, О.И. Цыганова); Иркутским научно-исследовательским противочумным институтом (С.В. Балахонов, М.Ю. Шестопалов); ГНЦ биотехнологии и вирусологии "Вектор" (Г.М. Игнатьев, Н.Л. Максимов, А.А. Неверов, В.А. Терновой, С.В. Нетесов); Биоком (А.Б. Комаров). 2. Рекомендованы к утверждению Комиссией по государственному санитарно-эпидемиологическому нормированию при Министерстве здравоохранения Российской Федерации (протокол N 20 от 2 декабря 2003 г.). 3. Утверждены и введены в действие Главным государственным санитарным врачом Российской Федерации, Первым заместителем Министра здравоохранения Российской Федерации Г.Г. Онищенко 5 декабря 2003 г. 4. Введены впервые. 1. Область применения 1.1. Методические указания предназначены для органов и учреждений государственной санитарно-эпидемиологической службы, а также могут быть использованы юридическими лицами, независимо от организационно-правовых форм и форм собственности, и индивидуальными предпринимателями, выполняющими в установленном порядке работы с объектами и материалами, содержащими или подозрительными на содержание микроорганизмов I - II групп патогенности: - диагностические (исследование объектов окружающей среды и клинического материала, в том числе от больных с подозрением на ТОРС); - экспериментальные; - производственные (работы по производству и контролю генодиагностических препаратов при условии соблюдения требований GMP). 1.2. Методические указания определяют принципы организации лабораторий и этапы выполнения ПЦР-анализа: взятие проб, первичная обработка, хранение, условия транспортирования, обеззараживание материала, выделение нуклеиновых кислот, проведение ПЦР (ОТ-ПЦР), учет и регистрация результатов при исследовании биологического материала, пищевых продуктов, материала из объектов окружающей среды. 1.3. Методические указания регламентируют выполнение исследований с использованием ПЦР-анализа, осуществляемого сертифицированными тест-системами и оборудованием и предусматривающего учет результатов методом электрофореза или гибридизационно-ферментного анализа (ГиФА). 2. Нормативные ссылки 2.1. Санитарно-эпидемиологические правила "Безопасность работы с микроорганизмами I - II групп патогенности (опасности)" СП 1.3.1285-03. 2.2. Санитарно-эпидемиологические правила "Порядок выдачи санитарно-эпидемиологического заключения о возможности проведения работ с возбудителями инфекционных заболеваний человека I - IV групп патогенности (опасности), генно-инженерно-модифицированными микроорганизмами, ядами биологического происхождения и гельминтами" СП 1.2.1318-03. 2.3. Санитарные правила и нормы "Правила сбора, хранения и удаления отходов лечебно-профилактических учреждений" СанПиН 2.1.7.728-99. 2.4. Методические указания "Обеззараживание исследуемого материала, инфицированного бактериями I - IV групп патогенности, при работе методом ПЦР" МУ 3.5.5.1034-01. М., 2001. 2.5. "Методические указания по детекции патогенной микрофлоры в клиническом материале, пищевых продуктах, объектах внешней среды и генетической идентификации клеток с помощью полимеразной цепной реакции". Госкомсанэпиднадзор России, 18.10.96, N 01-19/123-17. 2.6. Методические указания "Лабораторная диагностика сибирской язвы у животных и людей, обнаружение возбудителя в сырье животного происхождения и объектах внешней среды". МЗ СССР, 01.09.86, и Госагропром СССР, 01.09.86. 2.7. Методические указания "Лабораторная диагностика холеры" МУ 4.2.1097-02. М., 2002. 2.8. Методические указания "Профилактика и лабораторная диагностика бруцеллеза у людей" МУ 3.1.7.1189-03. М., 2003. 2.9. Методические указания "Сбор, учет и подготовка к лабораторному исследованию кровососущих членистоногих - переносчиков возбудителей природно-очаговых инфекций" МУ 3.1.1027-01. М., 2002. 2.10. "Методические рекомендации по проведению работ в диагностических лабораториях, использующих метод полимеразной цепной реакции". М., 1995. 2.11. Временные методические рекомендации "Лабораторная диагностика "атипичной пневмонии" (SARS) методом ПЦР", утв. Минздравом России 03.05.03. 2.12. Руководство по профилактике чумы. Саратов: Слово, 1992. 2.13. Руководство "Использование ультрафиолетового излучения для обеззараживания воздуха и поверхностей в помещениях" Р 3.1.683-98, МЗ РФ. 2.14. Инструкция по проектированию санитарно-эпидемиологических станций. СН 535-81. М.: Стройиздат, 1982. 3. Общие положения 3.1. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) основана на амплификации (многократном увеличении числа копий) фрагмента ДНК-мишени в условиях in vitro и позволяет обнаружить специфичный участок генома микроорганизма. 3.2. Аналитическая чувствительность тест-систем для выявления ДНК 2 4 (РНК) микроорганизмов методом ПЦР составляет 1 х 10 - 1 х 10 м.к. (геномных эквивалентов)/мл, специфичность - 85 - 100%, возможно исследование любого биологического материала и объектов окружающей среды, время выполнения анализа 4 - 8 ч. 3.3. Для выявления ДНК (РНК) микроорганизмов I - II групп патогенности ПЦР-анализ используют: - в качестве экспрессного метода при исследовании материала от больного (подозрительного на заболевание) и индикации патогенных биологических агентов (ПБА) в объектах окружающей среды; - как ускоренный предварительный тест при выполнении культурального и биологического методов исследования и для идентификации подозрительных культур; - для определения эпидемиологической значимости изолятов на основании выявления генетических маркеров вирулентности, например ctxA- и tcpA-генов у возбудителя холеры; - эпидемиологического мониторинга; - в научных целях для генотипирования штаммов или их ретроспективного анализа. 4. Требования к организации работ 4.1. Проведение исследований по выявлению ДНК (РНК) микроорганизмов I - II групп патогенности сопряжено с необходимостью одновременного обеспечения правил биологической безопасности работ и требований к организации и проведению ПЦР-анализа с целью предотвращения контаминации исследуемых проб нуклеиновыми кислотами (НК). 4.2. Противоэпидемический режим работы при ее организации и выполнении должен быть обеспечен в соответствии с СП 1.3.1285-03 "Безопасность работы с микроорганизмами I - II групп патогенности (опасности)", регламентирующими работу с микроорганизмами I - II групп патогенности. 4.3. Все этапы исследования материала, зараженного или подозрительного на зараженность вирусами I группы, проводят в условиях максимально изолированных лабораторий с использованием изолирующих средств индивидуальной защиты или в боксах биологической безопасности III класса в защитном костюме IV типа, дополненном резиновыми перчатками. 4.4. Исследования материала, инфицированного микроорганизмами I - II групп патогенности, методом ПЦР проводят в организациях, имеющих лицензию на деятельность, связанную с возбудителями инфекционных заболеваний человека, в лабораториях, имеющих санитарно-эпидемиологическое заключение о возможности проведения соответствующих работ (с указанием конкретных видов микроорганизмов). В этой же лаборатории могут проводиться ПЦР-исследования с микроорганизмами III - IV групп патогенности. 4.5. Допускается проведение исследований крови методом ПЦР на бруцеллез, парентеральные вирусные гепатиты, ВИЧ-инфекцию в лабораториях, имеющих санитарно-эпидемиологическое заключение о возможности проведения работ с возбудителями III группы патогенности, выданное в установленном порядке. 4.6. Передачу исследуемого материала в другие организации проводят в соответствии с п. п. 2.1.2 и 2.8.20 СП 1.3.1285-03 "Безопасность работы с микроорганизмами I - II групп патогенности (опасности)". 4.7. Работу по ПЦР-диагностике организует специалист с высшим образованием, прошедший обучение на лицензированных курсах специализации (повышения квалификации) по работе с ПБА I - II групп патогенности и по ПЦР-диагностике. 5. Требования к помещению и оборудованию ПЦР-лабораторий 5.1. Помещения, в которых проводят исследования на наличие НК микроорганизмов I - II групп патогенности, размещают в "заразной" зоне лаборатории, проводящей диагностические и другие исследования с указанными микроорганизмами. При наличии возможности помещения располагают в виде отдельного блока. При строительстве новых или реконструкции имеющихся помещений лабораторию ПЦР размещают в отдельно стоящем здании (изолированной части здания) с соблюдением требований СП 1.3.1285-03 "Безопасность работы с микроорганизмами I - II групп патогенности (опасности)" и учетом особенностей устройства вентиляционной системы ПЦР-лаборатории, изложенных в п. 5.19 настоящих Методических указаний. 5.2. Рабочая зона ПЦР-лаборатории в соответствии с этапами ПЦР-анализа должна включать следующий минимальный набор последовательно расположенных самостоятельных помещений (прилож. 1) <*> или отдельно выделенных рабочих зон (в составе других функциональных помещений): - приема, разборки, первичной обработки материала; - подготовки проб, выделения нуклеиновых кислот (НК); - приготовления реакционных смесей, проведения ПЦР и обратной транскрипции (ОТ); - учета результатов методом электрофореза или ГиФА. ------------------------------------ <*> Не приводится. 5.3. Комнату выделения НК располагают вблизи от комнаты приема материала, а помещение для учета результатов - по возможности в отдалении от других перечисленных помещений для обеспечения условий, исключающих занос в них продуктов амплификации (ампликонов) с воздушным потоком. 5.4. Не допускается выполнение ПЦР-исследований в помещениях для проведения работ с использованием культуральных (накопление патогенных биологических агентов) и генно-инженерных методов, в том числе связанных с получением (клонированием) и выделением рекомбинантных плазмид. 5.5. Зону приема, регистрации, сортировки, первичной обработки материала (объединение или разделение проб, центрифугирование, инактивацию и т.д.) располагают в комнате приема материала блока для работы с инфицированными животными или в отдельной боксированной комнате. В этих же помещениях может проводиться обработка проб к другим видам исследований (бактериологическое, вирусологическое, серологическое и т.д.). При наличии возможности в помещении устанавливают бокс биологической безопасности III класса защиты (допускается также использование бокса 2ШНЖ, например, фирмы "Изотоп" и др.) или бокс безопасности II класса защиты. 5.6. Зону по подготовке проб и выделению нуклеиновых кислот размещают в боксированном помещении (микробиологический бокс с предбоксом) или в комнате заражения и вскрытия животных. Работу проводят в боксе биологической безопасности II или III класса. В рабочей зоне располагают оборудование и предметы, необходимые только для предварительной обработки, выделения НК (примерный перечень представлен в Прилож. 2). 5.7. Зону приготовления реакционных смесей и проведения ОТ и ПЦР-амплификации располагают в боксированном помещении или боксе биологической безопасности II класса (или ПЦР-боксе) - для подготовки реакционных смесей для ОТ и ПЦР. 5.8. Работу по подготовке реакционных смесей для ПЦР и ОТ-ПЦР проводят до доставки в бокс проб, поступающих из зоны выделения НК. Смесь может быть приготовлена также за пределами помещений лаборатории, предназначенных для работы с заразным материалом, например в комнате (боксе) для розлива питательных сред. 5.9. При необходимости этап подготовки проб и выделения нуклеиновых кислот может выполняться в одной комнате с этапом ПЦР при наличии в ней бокса биологической безопасности II или III класса защиты для выделения НК и бокса биологической безопасности II класса (или ПЦР-бокса) - для подготовки реакционных смесей для ОТ и ПЦР. Каждый бокс рассматривается как соответствующая рабочая зона. 5.10. Зону детекции результатов располагают в боксированном помещении. При отсутствии боксированного помещения работу проводят в отдельной комнате, при возможности в ПЦР-боксе. 5.11. При одновременном использовании двух методов детекции продуктов амплификации - электрофоретического и ГиФА - следует выделить отдельные помещения или две рабочие зоны. Оборудование и принадлежности для каждого вида анализа маркируют применительно к каждой зоне. Обмен посудой и пипетками между зонами не допускается. 5.12. Помещения ПЦР-лаборатории покрывают кафелем (пол, стены) или масляной краской (стены, потолок), устойчивой к действию моющих и дезинфицирующих средств. 5.13. Во всех помещениях устанавливают бактерицидные лампы. Рекомендуется дополнительная установка переносного ультрафиолетового бактерицидного облучателя-рециркулятора. 5.14. Окна должны быть плотно закрыты. Для защиты рабочих столов от попадания прямого солнечного света используют светозащитные пленки из материала, устойчивого к дезинфицирующим средствам. Использование жалюзи не рекомендуется из-за адсорбции пыли. 5.15. Каждая рабочая зона должна иметь свой набор мебели, лабораторного оборудования, реагентов, автоматических пипеток, наконечников, пластиковой и стеклянной посуды, защитной одежды, обуви, резиновых перчаток, уборочного инвентаря и пр., используемых только в данной комнате (рабочей зоне). 5.16. Имущество каждой рабочей зоны должно иметь маркировку указанной зоны. Применение его в других помещениях или для других видов исследований не допускается. 5.17. В рабочих зонах должен быть свой набор холодильников (Прилож. 2): - в комнате приема материала от 4 до 8 ёС, минус 20 ёС и минус 70 ёС (при необходимости длительного хранения материала); - в комнате выделения нуклеиновых кислот от 4 до 8 ёС и минус 20 ёС для хранения набора выделения НК; от 4 до 8 ёС - для хранения препаратов НК; не допускается хранение проб материала или препаратов НК в одном холодильнике с компонентами набора для выделения НК; - в комнате ПЦР-амплификации от 4 до 8 ёС и минус 20 ёС - для хранения наборов обратной транскрипции и амплификации НК; - в комнате детекции продуктов амплификации от 4 до 8 ёС - для хранения наборов электрофоретической детекции и ГиФА. 5.18. Помещения ПЦР-лаборатории оборудуют приточно-вытяжной или вытяжной вентиляцией, соответствующей требованиям п. п. 2.3.16 и 2.4.3 СП 1.3.1285-03 "Безопасность работы с микроорганизмами I - II групп патогенности (опасности)". 5.19. При выполнении ПЦР воздухообмен внутри и между помещениями может повышать опасность контаминации проб из-за вероятности проникновения молекул НК и продуктов амплификации через фильтры. Снижение этой опасности достигается указанной ниже системой вентиляции лаборатории: - следует полностью исключить воздухообмен между помещением для детекции продуктов амплификации (пост-ПЦР-помещение) и остальными комнатами ПЦР-лаборатории, а также другими помещениями организации (давление воздуха в пост-ПЦР-помещении должно быть ниже, чем в указанных помещениях); - при смежном расположении комнаты приема материала и комнаты выделения нуклеиновых кислот давление в последней должно быть не ниже, чем в комнате приема материала; - если обе названные комнаты, входящие в пре-ПЦР-помещение, имеют смежное расположение с помещением для проведения ПЦР, давление воздуха в них должно быть ниже, чем в ПЦР-помещении; при отдаленном размещении ПЦР-помещения давление воздуха в нем должно быть не ниже, чем в пре-ПЦР-помещении. 5.20. Разница в давлении воздуха в помещениях ПЦР-лаборатории создается за счет различий в кратности воздухообмена в них. Расчеты кратности воздухообмена с учетом требований проведения ПЦР-анализа и требований "Инструкции по проектированию санитарно-эпидемиологических станций" СН 535-81 (М.: Стройиздат, 1982) приведены в таблице: --------------------------------------------------------------------- | Наименование помещения | Кратность | | | воздухообмена | | | (куб. м/ч) | |-----------------------------------------------|-------------------| | | приток | вытяжка | |-----------------------------------------------|--------|----------| | Зона приема и первичной обработки материала | 5 | 6 | |-----------------------------------------------|--------|----------| | Зона подготовки проб и выделения нуклеиновых | 5 | 6 | | кислот | | | |-----------------------------------------------|--------|----------| | Зона приготовления реакционных смесей, | 5 | 5 | | проведения ПЦР и ОТ-ПЦР | | | |-----------------------------------------------|--------|----------| | Зона учета результатов методом электрофореза | 5 | 7 | | или ГиФА | | | --------------------------------------------------------------------- 5.21. При отсутствии системы вентиляции, указанной в п. п. 5.18 - 5.19, уменьшение вероятности контаминации проб достигается мерами по ограничению воздухообмена между помещениями ПЦР-лаборатории. 5.22. При необходимости в ПЦР-лаборатории могут быть установлены кондиционеры в соответствии с п. 2.4.5 СП 1.3.1285-03 "Безопасность работы с микроорганизмами I - II групп патогенности (опасности)". 6. Требования к проведению работ 6.1. Взятие материала производят согласно инструктивно-методическим документам, регламентирующим выполнение исследований для каждого вида возбудителя инфекций (Прилож. 3), инструкциям к тест-системам и в соответствии с СП 1.3.1285-03 "Безопасность работы с микроорганизмами I - II групп патогенности (опасности)". 6.2. Транспортирование исследуемого материала и промежуточных продуктов ПЦР-анализа из одного помещения в другое при невозможности передачи их в смежные комнаты через шлюзовые передаточные окна осуществляют в плотно закрывающихся контейнерах, обрабатываемых дезинфицирующими средствами после каждого переноса проб. 6.3. Доставку проб для исследования, а также их хранение осуществляют в закрывающихся металлических или пластмассовых контейнерах, на дне которых размещают адсорбирующий материал (марлевая салфетка, ткань, вата и пр.), смоченный раствором дезинфицирующего средства. Контейнер помещают в сумку-холодильник или в контейнер с хладагентами. 6.4. Манипуляции, сопровождающиеся риском образования аэрозоля (встряхивание, центрифугирование и т.д.) при обработке материала и выделении нуклеиновых кислот, выполняют в боксах биологической безопасности II или III класса. 6.5. Приборы, оборудование и средства измерения должны быть аттестованы (поверены), технически исправны, иметь технический паспорт и рабочую инструкцию по эксплуатации. 6.6. Наконечники должны строго соответствовать автоматическим пипеткам, пробирки для амплификации - термоциклерам (в соответствии с инструкцией фирмы-производителя прибора). Обязательной является смена наконечников для автоматических пипеток после завершения каждой манипуляции. 7. Требования к защитной одежде 7.1. Выбор типа защитного костюма проводится в строгом соответствии с СП 1.3.1285-03 "Безопасность работы с микроорганизмами I - II групп патогенности (опасности)" и определяется видом возбудителя, рабочей зоной ПЦР, оснащением ее боксами биологической безопасности (Прилож. 3). 7.2. Прием и первичную обработку материала, доставленного на исследование (объединение или разделение проб, центрифугирование, инактивацию и т.д.), выполняют в защитном костюме I - II или IV типа, дополненном перчатками и, при необходимости, респиратором. 7.3. В помещении подготовки проб и выделения НК при исследовании материала, инфицированного бактериями I - II групп, подвергнутыми инактивации на этапе подготовки проб, работу проводят в боксе биологической безопасности II класса в костюме IV типа, дополненном резиновыми перчатками. 7.4. В связи с отсутствием регламентированных методов инактивации вирусов II группы работу с материалом, зараженным или подозрительным на зараженность возбудителями КГЛ, ТОРС, ГЛПС, ОГЛ, проводят в боксе биологической безопасности III класса защиты в костюме IV типа и резиновых перчатках или в боксе биологической безопасности II класса в костюме I типа. Работу с другими вирусами II группы проводят в боксе биологической безопасности II класса в защитном костюме IV типа, дополненном резиновыми перчатками и респиратором. 7.5. На этапах проведения ПЦР, учета результатов работу проводят в следующих видах защитной одежды: - с обеззараженным материалом - в костюме IV типа, дополненном резиновыми перчатками; - с пробами, инфицированными возбудителями КГЛ, ТОРС, ГЛПС, ОГЛ, - в костюме I типа или в боксе биологической безопасности II класса в костюме IV типа, дополненного резиновыми перчатками и респиратором. Работу с другими вирусами II группы проводят в защитном костюме IV типа, дополненном респиратором и резиновыми перчатками. 7.6. В пост-ПЦР-помещении должны работать сотрудники, не занятые на этапах подготовки проб и постановки ПЦР, при входе в помещение надевают бахилы или сменную обувь. 7.7. Надевание и снятие защитной одежды производят в предбоксах. В каждом из них должен быть отдельный комплект защитной одежды и обуви. 7.8. Наиболее загрязненной продуктами амплификации считается защитная одежда зоны детекции, и в первую очередь, резиновые перчатки. Перед снятием одежды необходимо заменить перчатки на чистые. 7.9. Обработку одежды из комнат подготовки проб, ПЦР-амплификации и учета результатов проводят раздельно. 8. Требования к обработке помещений и обеззараживанию материала 8.1. Обработку помещений проводят в соответствии с требованиями СП 1.3.1285-03 "Безопасность работы с микроорганизмами I - II групп патогенности (опасности)". В комнатах, в которых проводят работу с выделенными НК, рабочие поверхности, штативы, оборудование следует обеззараживать ежедневно ультрафиолетовым излучением в течение 1 ч до начала работы и после нее, полы подвергать ежедневной влажной уборке дезинфицирующими средствами, регламентированными указанными санитарными правилами, или 0,2%-ным раствором ДП-2Т, обладающим также способностью инактивировать ампликоны. Перед началом работы рабочую поверхность столов дополнительно обрабатывают 70%-ным этиловым спиртом. Ежемесячно проводят профилактическую обработку рабочей поверхности столов, оборудования, штативов 0,2%-ным раствором ДП-2Т. 8.2. Дважды в год (при необходимости чаще) осуществляют обработку автоматических дозаторов. Дозаторы разбирают, обрабатывают моющим раствором для удаления жирового загрязнения, после чего остатки моющего средства удаляются ветошью, смоченной водой. Затем проводят обработку 1 N соляной кислотой; время экспозиции - 1 ч. Остатки раствора тщательно удаляют ветошью, смоченной водой, и проводят обеззараживание влажных поверхностей ультрафиолетовым излучением в течение 1 ч. По окончании обработки дозаторы собирают и проводят калибровку в соответствии с прилагаемой инструкцией по пользованию дозаторами. Автоклавируемые дозаторы обеззараживают паром под давлением 2,0 кГс/кв. см (0,2 МПа) при температуре 132 +/- 2 ёС в течение 60 мин. 8.3. Обеззараживание проб проводят в соответствии с МУ 3.5.5.1034-01 "Обеззараживание исследуемого материала, инфицированного бактериями I - IV групп патогенности, при работе методом ПЦР". Порядок обеззараживания проб и режимы дезактивации при постановке ПЦР представлены в Прилож. 4 и 5. 8.4. При возникновении контаминации (получении повторных положительных результатов в отрицательных контролях, а также при тестировании контрольных смывов) в помещениях проводят мероприятия по ликвидации контаминации. Объем мероприятий зависит от масштаба контаминации, определяемого результатами исследования смывов (Прилож. 6). Проведение ПЦР-исследований до завершения деконтаминационных мероприятий не допускается. 9. Проведение внутрилабораторного контроля 9.1. Внутрилабораторный контроль проводят с периодичностью, зависящей от объема выполняемой работы. Периодичность определяется руководителем лаборатории. 9.2. Контроль осуществляют путем исследования шифрованных "положительных" и "отрицательных" проб. В качестве "положительных" могут использоваться образцы, искусственно контаминированные НК, или уже ранее исследованные пробы, хранившиеся не более 1 недели при температуре минус 20 ёС. В этих пробах определяют НК тех же возбудителей, что и при первичном исследовании. В качестве "отрицательных" применяют образцы, не содержащие НК возбудителей инфекционных заболеваний, например транспортная среда, ДНК-буфер. 9.3. Количество проб должно быть достаточным для оценки работы сотрудников и выявления контаминированных участков лаборатории. 9.4. Для выявления возможной контаминации лаборатории нуклеиновыми кислотами контроль проводят путем взятия смывов с поверхностей (Прилож. 6). Приложение 2 ПРИМЕРНОЕ РАЗМЕЩЕНИЕ ОБОРУДОВАНИЯ В РАБОЧИХ ЗОНАХ ПЦР-ЛАБОРАТОРИИ Для обработки материала 1. Бокс биологической безопасности III класса защиты (допускается использование бокса 2ШНЖ, например, фирмы "Изотоп" и др.) или бокса биологической безопасности II класса защиты. 2. Центрифуга для пробирок объемом 5 - 100 мл. 3. Центрифуга/вортекс. 4. Микроцентрифуга до 16000 g для микроцентрифужных пробирок объемом 1,5 мл. 5. Твердотельный термостат для пробирок объемом 1,5 мл с диапазоном рабочих температур 25 - 100 град.С. 6. Вакуумный отсасыватель медицинский с колбой-ловушкой. 7. Отдельный набор автоматических пипеток переменного объема. 8. Одноразовые полипропиленовые микроцентрифужные пробирки с завинчивающимися или плотно закрывающимися крышками объемом 1,5 мл. 9. Одноразовые наконечники для пипеток переменного объема с аэрозольным барьером до 200 и до 1000 мкл. 10. Одноразовые наконечники для пипеток переменного объема до 200 мкл. 11. Штативы для наконечников, микропробирок объемом 1,5 мл. 12. Холодильник с камерами, поддерживающими температуру от 2 до 8 град.С, минус 20 град.С и минус 70 град.С (при необходимости длительного хранения материала). 13. Емкость с дезинфицирующим раствором. Для выделения НК 1. Бокс биологической безопасности II или III класса биозащиты. 2. Центрифуга/вортекс. 3. Микроцентрифуга от 12 до 16000 g для микроцентрифужных пробирок объемом 1,5 мл. 4. Твердотельный термостат для пробирок объемом 1,5 мл с диапазоном рабочих температур 25 - 100 град.С. 5. Вакуумный отсасыватель медицинский с колбой-ловушкой. 6. Отдельный набор автоматических пипеток переменного объема. 7. Одноразовые полипропиленовые завинчивающиеся или плотно закрывающиеся пробирки объемом 1,5 мл. 8. Одноразовые наконечники для пипеток переменного объема с аэрозольным барьером до 200 и до 1000 мкл. 9. Одноразовые наконечники для пипеток переменного объема до 200 мкл. 10. Штативы для наконечников, микропробирок на 1,5 мл. 11. Холодильник с камерами, поддерживающими температуру от 2 до 8 град.С, минус 20 град.С. Для проведения обратной транскрипции и амплификации 1. Бокс биологической безопасности II класса или настольный бокс с бактерицидной лампой. 2. Амплификатор. 3. Отдельный набор автоматических пипеток переменного объема. 4. Одноразовые полипропиленовые пробирки для амплификации объемом 0,5 (0,2) мл. 5. Одноразовые наконечники для пипеток переменного объема с аэрозольным барьером до 100 мкл, свободные от РНКаз. 6. Штативы для наконечников, микропробирок на 0,5 (0,2) мл. 7. Холодильник с камерами, поддерживающими температуру от 2 до 8 град.С, минус 20 град.С. 8. Емкость для сброса отработанных расходных материалов. Для электрофоретического анализа продуктов ПЦР 1. Камера для горизонтального электрофореза. 2. Источник постоянного тока с напряжением 150 - 460 В. 3. Ультрафиолетовый трансиллюминатор с кабинетом для просмотра гелей. 4. Видеосистема с цифровой видеокамерой для регистрации результатов. 5. Компьютер (должен быть связан через компьютерную сеть с компьютером, располагающимся в чистой зоне и предназначенным для анализа результатов электрофореза). 6. Аквадистиллятор. 7. Микроволновая печь для плавления агарозы. 8. Колба коническая из термостойкого стекла для плавления агарозы объемом 250 мл. 9. Мерный цилиндр объемом 1 л. 10. Штатив для микропробирок на 0,5 мл. 11. Отдельная автоматическая пипетка 10 - 40 мкл. 12. Одноразовые наконечники для пипеток переменного объема до 200 мкл в штативе. 13. Холодильник с камерой, поддерживающей температуру от 2 до 8 град.С. 14. Емкость для сброса отработанных расходных материалов. 15. Пластиковая емкость объемом 5 л для дезактивации буфера и гелей, содержащих бромид этидия. Для гибридизационно-ферментной детекции продуктов ПЦР 1. Термостат планшетный, поддерживающий температуру 37 град.С. 2. Вошер (не обязательно). 3. Планшетный спектрофотометр. 4. Компьютер (должен быть связан через компьютерную сеть с компьютером, располагающимся в чистой зоне и предназначенным для анализа результатов гибридизации). 5. Восьмиканальная пипетка до 200 мкл. 6. Отдельный набор одноканальных автоматических пипеток переменного объема. 7. Одноразовые наконечники для пипеток переменного объема. 8. Мерный цилиндр объемом 1 л. 9. Холодильник с камерой, поддерживающей температуру от 2 до 8 град.С. 10. Емкость для сброса отработанных расходных материалов. Приложение 3 ИСПОЛЬЗОВАНИЕ СРЕДСТВ ИНДИВИДУАЛЬНОЙ ЗАЩИТЫ В РАБОЧИХ ЗОНАХ ПЦР-ЛАБОРАТОРИИ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- | Этап ПЦР-анализа | Вирусы | Вирусы II | Чума, | Глубокие | Бруцеллез, | Риккетсиозы | Холера | | (рабочая зона) | I | группы | сап, | микозы | туляремия, | | | | | группы | | мелиоидоз | | сибирская | | | | | | | | | язва | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |---------------------------|-------------|--------------------------|------------|--------------------|------------|--------------------------|---------------| | | | КГЛ, | другие | | | | | | | | | ТОРС, | | | | | | | | | | ГЛПС, | | | | | | | | | | ОГЛ | | | | | | | |---------------------------|-------------|------------|-------------|------------|--------------------|------------|--------------------------|---------------| | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------| | I. Блок для работы с инфицированными животными | |--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------| | Прием, разбор, первичная | инфицированными животными | | обработка клинического | в условиях максимально изолированных лабораторий | | материала от больных с | ИСИЗ или боксы биологической безопасности III класса + | | неясной этиологией (не | защитная одежда IV типа + РП | | исключая наличия вирусов | | | I группы) | | |---------------------------|----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------| | Прием, разбор, первичная | ИСИЗ | при наличии возможности устанавливают бокс | | обработка: | <*> | биологической безопасности (БББ) II или III класса | | | или | | | - клинического материала | БББ | | | от больных с подозрением | III |--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------| | на ООИ; | класса | | | | | | | | | | + IV | | | | | | | | |---------------------------|-------------|------------|-------------|------------|--------------------|------------|--------------------------|---------------| | - проб объектов | тип + | | | | | | | | | окружающей среды | РП | | | | | | | | | | <**> | | | | | | | | |---------------------------|-------------|------------|-------------|------------|--------------------|------------|--------------------------|---------------| | | | I тип | II | I тип | I тип | II | II тип | IV | | | | | тип | | | тип | | тип | | | | | | | | | | + РП | |---------------------------|-------------|--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------| | Подготовка проб, | ИСИЗ | бокс биологической безопасности II класса | | выделение нуклеиновых | или |--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------| | кислот | БББ | | | | | | | | | | III | | | | | | | | | | класса | | | | | | | | | | + IV | | | | | | | | | | тип + | | | | | | | | | | РП | | | | | | | | |---------------------------|-------------|------------|-------------|------------|--------------------|------------|--------------------------|---------------| | | | I тип | II | I тип | I тип | II | II тип | IV | | | | | тип | | | тип | | тип | | | | | | | | | | + РП | |--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------| | II. Боксированное помещение (микробиологический бокс с предбоксом) | |--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------| | Прием, разбор, первичная | ИСИЗ | бокс биологической безопасности II класса | | обработка материала | или |--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------| | | БББ | | | | | | | | | | III | | | | | | | | | | класса | | | | | | | | | | + IV | | | | | | | | | | тип + | | | | | | | | | | РП | | | | | | | | |---------------------------|-------------|------------|-------------|------------|--------------------|------------|--------------------------|---------------| | | | I тип | IV | IV | IV | IV | IV тип | IV | | | | | тип | тип | тип | тип | + РП + | тип | | | | | + респиратор| + РП | + РП | + РП | респиратор | + РП | | | | | + РП | + | + респиратор | | | | | | | | | респиратор | | | | | | | | | | (мелиоидоз)| | | | | |---------------------------|-------------|--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------| | | | бокс биологической безопасности III класса | |---------------------------|-------------|--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------| | | | IV | IV | IV | IV | IV | IV тип | IV | | | | тип | тип | тип | тип | тип | + РП | тип | | | | + РП | + РП | + РП | + РП | + РП | | + РП | |---------------------------|-------------|--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------| | | | при отсутствии бокса биологической безопасности | | | |--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------| | | | I тип | II | I тип | I тип | I тип | II тип | IV | | | | | тип | | | | | тип | | | | | | | | | | + РП | |---------------------------|-------------|--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------| | Подготовка | ИСИЗ | бокс биологической безопасности II класса | | необеззараженных проб, | или |--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------| | выделение нуклеиновых | БББ | | | | | | | | | кислот | III | | | | | | | | | | класса | | | | | | | | | | + IV | | | | | | | | | | тип + | | | | | | | | | | РП | | | | | | | | |---------------------------|-------------|------------|-------------|------------|--------------------|------------|--------------------------|---------------| | | | I тип | IV | IV | IV | IV | IV тип | IV | | | | | тип | тип | тип | тип | + респиратор + РП | тип | | | | | + | + РП | + респиратор | + РП | | + РП | | | | | респиратор | + | + РП | | | | | | | | + РП | респиратор | | | | | | | | | | (мелиоидоз)| | | | | |---------------------------|-------------|--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------| | | | бокс биологической безопасности III класса | |---------------------------|-------------|--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------| | | | IV | IV | IV | IV | IV | IV тип | IV | | | | тип | тип | тип | тип | тип | + РП | тип | | | | + РП | + РП | + РП | + РП | + РП | | + РП | |---------------------------|----------------------------------------|------------|--------------------|------------|--------------------------|---------------| | Подготовка обеззараженных | отсутствуют | БББ | отсутствуют | БББ | отсутствуют | БББ | | проб, выделение | регламентированные способы | II | регламентированные | II | регламентированные | II | Страницы: 1 2 |